Nuorilla urheilijoilla (11-17-vuotta) kipeytynyt selkä on aina hälytysmerkki mahdollisesta selän rasitusmurtumasta. Kipeää selkää ei saa kuormittaa ja tilanne on hyvä arvoida magneettikuvauksella.
Selkärangan välilevystä lähtöisin oleva kipu on selkäkipujen yleisin syy. Välilevy ei näy röntgenkuvassa ja röntgenkuva ei olekaan hyvä tutkimus selkäkipuisella potilaalla. Välilevy näkyy magneettikuvauksella.
Selän nivelissä voi olla nivelrikkoa (yli 50-vuotiaat potilaat). Kulunut nivel on turvoksissa, nesteilee ja nivelen nurkkiin tulee luista liikakasvua. Luiden liikakasvu saattaa ahtauttaa selkäytimessä kulkevien hermojen kulkua. Tämä näkyy magneettikuvissa.
Iäkkäillä luiden haurastuminen on yleistä. Selkärangan nikama voi murtua jo pienestä vammasta, joskus ilman vammaakin esimerkikisi televisiota paikasta toiseen siirtäessä. Murtumat näkyvät parhaiten magneettikuvauksella, mutta jos sitä ei ole saatavissa niin röntgenkuvasta on usein myös hyötyä.
Syöpä selkäkivun taustalla on onneksi hyvin harvinainen. Tauti diagnosoidaan magneettikuvauksella.
Ahdistaessaan hermoja, selässä oleva sairaus voi antaa valtaosan oireistaan selän ulkopuolelta, tyypillisesti pakaraan ja alaraajaan säteilevänä kipuna. Kipukohdan kuvaamisesta ei ole tällöin hyötyä vaan kuvaus kannattaa kohdentaa kivun lähteille, lannerankaan.
Jos alaraajat toimivat normaalisti, selän kuvaaminen voi selvittää kivun syyn, mutta aikuisella tästä ei useinkaan ole hoidollista hyötyä. Selkä on tärkeä kuvata, jos kipuihin liittyy toiminnanhäiriöitä pysyvien toiminnallisten muutosten välttämiseksi. Myös sietämättömän kovat kivut ovat syy selän kuvaamiseen magneettikuvauksella.